RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 XKRXQ6PP77 449 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ASCL4Q6XD76 172 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NSMAFQ92636 917 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SRRQ9GZT4 340 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0A6YYH2 397 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A6NJ64 397 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 APOL3O95236 402 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ADRB1P08588 477 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF823P16415 610 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SRMP19623 302 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SDC2P34741 201 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SFTPDP35247 375 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TIMP3P35625 211 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 EVX1P49640 407 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GSK3AP49840 483 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TBR1Q16650 682 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR2A2Q6IF42 318 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 DRAM2Q6UX65 266 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 Q6ZNX1 250 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SSX8Q7RTT4 187 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SYT14Q8NB59 555 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TECTBQ96PL2 329 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OPA3Q9H6K4 179 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 JKAMPQ9P055 326 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA2Q9UM82 520 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 BSNQ9UPA5 3926 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SULT1B1O43704 296 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 WDR1O75083 606 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 UPK1BO75841 260 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CDRT1O95170 752 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SYNGR4O95473 234 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 HSMCR30P0CW71 290 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RAB6AP20340 208 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 HSD11B1P28845 292 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ATP6V1E1P36543 226 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF79Q15937 498 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MZT2AQ6P582 158 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 Q8NFD4 153 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TAAR6Q96RI8 345 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.66□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TVP23AA6NH52 213 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LRRTM2O43300 516 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TMPRSS3P57727 454 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 QRFPP83859 136 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SARAFQ96BY9 339 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO17Q96EF6 278 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 WBP1Q96G27 269 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GALNT8Q9NY28 637 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MEGF11A6BM72 1044 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 MPZL1O95297 269 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 APOA1P02647 267 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ACSM4P0C7M7 580 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PRF1P14222 555 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 GABRA1P14867 456 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 RAB3BP20337 219 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 MYL9P24844 172 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CAMK2DQ13557 499 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms