RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NTF4P34130 210 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP1P43487 201 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DNASE1L1P49184 302 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SOX8P57073 446 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR2B6P58173 313 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 BTG1P62324 171 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DGCR2P98153 550 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 NHLH1Q02575 133 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G7Q13093 441 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 IL18Q14116 193 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM225Q6GV28 225 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 CREB3L2Q70SY1 520 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DCXRQ7Z4W1 244 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF248Q8NDW4 579 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR1J4Q8NGS1 313 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A6Q92536 515 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM106AQ96A25 262 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 UPRTQ96BW1 309 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 HAVCR1Q96D42 359 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLAMF6Q96DU3 332 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 LRP3O75074 770 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 HPNP05981 417 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MDS2Q8NDY4 140 aa4.99□□□□□ -1.61
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