RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 AGAP11Q8TF27 550 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF14Q92915 247 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RPEQ96AT9 228 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H4GQ99525 98 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSZQ9UBR2 303 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 COL6A3P12111 3177 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF1AQ12756 1690 aa3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 FMN2Q9NZ56 1722 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SBNO1A3KN83 1393 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC37A3O60309 1634 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 IQGAP3Q86VI3 1631 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0G2JRQ6 117 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SMKR1H3BMG3 65 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA8RI6L899 631 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TOR1AO14656 332 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 INSIG1O15503 277 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 HCRTR1O43613 425 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 FKBP6O75344 327 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TDP2O95551 362 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCR2P25025 360 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CD40LGP29965 261 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PCK1P35558 622 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2B6P58173 313 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF92Q03936 586 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF691Q5VV52 312 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NELFCDQ8IXH7 590 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 MED8Q96G25 268 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINB12Q96P63 405 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NODALQ96S42 347 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXC2Q99958 501 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 OR51J1Q9H342 316 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf198Q9H425 327 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TREM2Q9NZC2 230 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 E9PCH4 1651 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ALS2Q96Q42 1657 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NAIPQ13075 1403 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP7BP35670 1465 aa3.67□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SCN5AQ14524 2016 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMB11A5LHX3 300 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NIZ1 184 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 HACD1B0YJ81 288 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SOCS3O14543 225 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFSF11O14788 317 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZW10O43264 779 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SNAI2O43623 268 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NTN1O95631 604 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOCP08134 193 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SNHG28P0DPA3 235 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK4P11802 303 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 NTSP30990 170 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ARR3P36575 388 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 GLP1RP43220 463 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 DNASE1L1P49184 302 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 KLK7P49862 253 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGA2P52926 109 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RAP1BP61224 184 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35B1P78383 322 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 DR1Q01658 176 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL2L1Q07817 233 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLAMF1Q13291 335 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC119Q13432 240 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.66□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LEMD1Q68G75 181 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms