RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ECH1Q13011 328 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TAF13Q15543 124 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RAB11BQ15907 218 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EMC4Q5J8M3 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PHF19Q5T6S3 580 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZS52 159 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 BAP18Q8IXM2 172 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 BMPERQ8N8U9 685 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN23Q96B33 292 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SERINC2Q96SA4 455 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GFI1Q99684 422 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 APOOQ9BUR5 198 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA4BQ9H853 241 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 VCANP13611 3396 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TO15178 435 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ND4LP03901 98 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CD74P04233 296 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GYPBP06028 91 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CD2P06729 351 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SPP1P10451 314 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CLUP10909 449 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SDHAP31040 664 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RABIFP47224 123 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM8P78325 824 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DHRS2Q13268 280 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CSRP2Q16527 193 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP5Q16690 384 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FCRL6Q6DN72 434 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LYG2Q86SG7 212 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD1Q8N668 190 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K13Q8NH42 304 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MITD1Q8WV92 249 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NMES1Q9C002 83 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TREM1Q9NP99 234 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 KPTNQ9Y664 436 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NCOR1O75376 2440 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NUMA1Q14980 2115 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0G2JN53 185 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB7A8K855 629 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC31A1O15431 190 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF208O43345 1280 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FADS1O60427 444 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A12O75746 678 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CD3DP04234 171 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CRYBA1P05813 215 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB6P28072 239 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ELOCQ15369 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM189A2Q15884 450 aa6.47□□□□□ -1.37
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