RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 XKR8Q9H6D3 395 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 COL1A2P08123 1366 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 C7orf66A4D0T2 115 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD51BO15315 384 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH16O75309 829 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5H8P0DN80 308 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 TCN2P20062 427 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CD9P21926 228 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 SLC11A1P49279 550 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 HADHBP55084 474 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO48Q5FWF7 155 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 ARRDC1Q8N5I2 433 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 OR8K3Q8NH51 312 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A13Q8TCU3 470 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC126Q96EE4 140 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10C1Q96KK4 312 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ING2Q9H160 280 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.09□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 USP47Q96K76 1375 aa2.09□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 RAB29O14966 203 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXN2P32314 431 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 TMED10P49755 219 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 RPS15P62841 145 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 XKR7Q5GH72 579 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 NEURL3Q96EH8 262 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF382Q96SR6 550 aa2.08□□□□□ -2.08
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0U1RQV1 116 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 AKR7A2O43488 359 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJB6O75190 326 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT34O76011 436 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
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