RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 QDPRP09417 244 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD16Q6P6B7 361 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GHITMQ9H3K2 345 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CLDN17P56750 224 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ANGPT1Q15389 498 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 BIVMQ86UB2 503 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A28Q96A46 364 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ING3Q9NXR8 418 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TPPPO94811 219 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 AP3S2P59780 193 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SGCZQ96LD1 299 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TAAR9Q96RI9 348 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ZPBPQ9BS86 351 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GGT3PA6NGU5 568 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CBR3O75828 277 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TTRP02766 147 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 YES1P07947 543 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ACSM4P0C7M7 580 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ICAM2P13598 275 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DCTDP32321 178 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CHAF1BQ13112 559 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SDK2Q58EX2 2172 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JMM0 328 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PPB8 328 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PRS3 328 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CD37P11049 281 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 HTR2CP28335 458 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SPOCK1Q08629 439 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SSPNQ14714 243 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 HPP00738 406 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 JMJD7P0C870 316 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 UCN2Q96RP3 112 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 MED28Q9H204 178 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DIABLOQ9NR28 239 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CIB4A0PJX0 185 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 KDM4BO94953 1096 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GSTT2BP0CG30 244 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CD59P13987 128 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ZNF17P17021 662 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 RAG2P55895 527 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 TOMM20Q15388 145 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 FCN2Q15485 313 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GSG1Q2KHT4 349 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 OR56B4Q8NH76 319 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 LOXL4Q96JB6 756 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SPRY4Q9C004 299 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PCSK5Q92824 1860 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 MEGF11A6BM72 1044 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ZNF878C9JN71 531 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 RCVRNP35243 200 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GABREP78334 506 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 MAB21L1Q13394 359 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 FGGYQ96C11 551 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DDA1Q9BW61 102 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 PLSCR3Q9NRY6 295 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 C9orf172C9J069 976 aa20.26■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 RER1O15258 196 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms