RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 GP1BAP07359 652 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 TAF13Q15543 124 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 TMEM17Q86X19 198 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C8orf44Q96CB5 159 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 VSIG4Q9Y279 399 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ABCD4O14678 606 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SPARCP09486 303 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CD96P40200 585 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PMPCAQ10713 525 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR10K2Q6IF99 312 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ASB17Q8WXJ9 295 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LDLRAD4O15165 306 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 IL33O95760 270 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CSN2P05814 226 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CD37P11049 281 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 GABRA4P48169 554 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC18B1Q6NT16 456 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LPCAT3Q6P1A2 487 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CORO6Q6QEF8 472 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PRODH2Q9UF12 536 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 COL6A3P12111 3177 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 XKRYO14609 159 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PIAS2O75928 621 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ATP1B3P54709 279 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ROM1Q03395 351 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CLDN23Q96B33 292 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PRSS37A4D1T9 235 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CXCL12P48061 93 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LINC00518Q8N0U6 118 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB8AQ96BR9 441 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CMKLR1Q99788 373 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 FAM117AQ9C073 453 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CKLFQ9UBR5 152 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TMEM235A6NFC5 223 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 K7ESF4 209 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC16A7O60669 478 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 FSTP19883 344 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 DLSTP36957 453 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 MRGPRFQ96AM1 343 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 COMMD9Q9P000 198 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR14I1A6ND48 311 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 C17orf105B2RV13 164 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB25P24278 435 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CAPZA1P52907 286 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR1D5P58170 312 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF117Q03924 483 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ACKR1Q16570 336 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LIN54Q6MZP7 749 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF519Q8TB69 540 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PDE7BQ9NP56 450 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LRP12Q9Y561 859 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 FITM1A5D6W6 292 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 WIPF3A6NGB9 483 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TLCD2A6NGC4 264 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 MYF5P13349 255 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CTLA4P16410 223 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZP2Q05996 745 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SPOCK1Q08629 439 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 VWA2Q5GFL6 755 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CD163Q86VB7 1156 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms