RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pax4P32115 349 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b26P36369 261 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10644Q3TZG3 87 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il12rb1Q60837 738 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcap29Q61334 240 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SynprQ8BGN8 265 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxj3Q8BUR3 623 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc36Q8VBW8 186 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acy3Q91XE4 318 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mdm1Q9D067 708 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EurlQ9D7G4 290 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plxdc2Q9DC11 530 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bmp10Q9R229 421 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dmrtb1A2A9I7 359 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3327F7C9A1 213 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Susd5G3UW60 619 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgif1P70284 272 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Entpd6Q3U0P5 455 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpa2Q62193 270 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1281Q7TQY6 305 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acot4Q8BWN8 421 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r208Q8R275 308 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr120Q8VFQ2 330 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr2hQ923G2 150 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ripply3Q924S9 152 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Paqr4Q9JJE4 273 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brca2P97929 3329 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F8Q06194 2319 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm1330D3Z460 184 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r16E9Q025 850 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rplp0P14869 317 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fabp7P51880 132 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klf16P58334 251 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FapP97321 761 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxd1Q01822 328 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces2fQ08ED5 561 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alg11Q3TZM9 492 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1rlQ3UZ09 482 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kyat3Q71RI9 455 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc75aQ7TSF4 339 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmtm4Q8CJ61 208 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr826Q8VFU6 313 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr825Q8VFU7 320 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pycr1Q922W5 309 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Raf1Q99N57 648 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actr6Q9D864 396 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt22Q9DD16 308 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr179E9PY61 2293 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr727A2RTN7 324 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr31E9Q3K2 317 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr66F8VQ01 311 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntn1O09118 604 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc30a4O35149 430 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grap2O89100 322 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp13P10754 512 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl27P61358 136 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GnrhrQ01776 327 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k3Q61084 626 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp748Q7TPL6 888 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gas2l1Q8JZP9 678 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr837Q8VFJ4 312 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr522Q8VGL1 312 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan32Q9JHH2 256 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gmeb1Q9JL60 562 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo15Q9QZN0 433 aa19■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5519D3Z175 170 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r14H3BJ46 303 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8660K7N6J2 305 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r28L7N203 852 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aqp8P56404 261 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EbpP70245 230 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc30a2Q2HJ10 371 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxl1Q64731 336 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntf4Q80VU4 209 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vrk1Q80X41 440 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam221aQ8C790 301 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plcz1Q8K4D7 647 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aqp3Q8R2N1 292 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr790Q8VGJ3 322 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex44Q9DA60 530 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr888Q9EQA5 314 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17087V9GXQ2 156 aa18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss47A0A0N4SVQ0 395 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd60A2AMD2 318 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1511E9PWU0 318 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1510E9PZZ6 318 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alx3O70137 343 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CcnjQ3TZI6 379 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Opa3Q505D7 179 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1287Q7TQY1 305 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mogat2Q80W94 334 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cbr3Q8K354 277 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r200Q8R281 312 aa18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tubg2Q8VCK3 451 aa18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.8 ms