Protein–RNA interactions for Protein: P56404

Aqp8, Aquaporin-8, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp8P56404 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Aqp8P56404 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aqp8P56404 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aqp8P56404 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aqp8P56404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Aqp8P56404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aqp8P56404 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Aqp8P56404 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Aqp8P56404 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Aqp8P56404 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aqp8P56404 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aqp8P56404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Aqp8P56404 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aqp8P56404 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aqp8P56404 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Aqp8P56404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Aqp8P56404 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Aqp8P56404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Aqp8P56404 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Aqp8P56404 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Aqp8P56404 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Aqp8P56404 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aqp8P56404 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Aqp8P56404 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aqp8P56404 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Aqp8P56404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aqp8P56404 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Aqp8P56404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Aqp8P56404 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Aqp8P56404 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aqp8P56404 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aqp8P56404 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aqp8P56404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aqp8P56404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aqp8P56404 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aqp8P56404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aqp8P56404 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aqp8P56404 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aqp8P56404 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aqp8P56404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aqp8P56404 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aqp8P56404 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aqp8P56404 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aqp8P56404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Aqp8P56404 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aqp8P56404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aqp8P56404 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aqp8P56404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aqp8P56404 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aqp8P56404 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aqp8P56404 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Aqp8P56404 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Aqp8P56404 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aqp8P56404 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aqp8P56404 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aqp8P56404 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aqp8P56404 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Aqp8P56404 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aqp8P56404 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aqp8P56404 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aqp8P56404 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aqp8P56404 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aqp8P56404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aqp8P56404 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aqp8P56404 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Aqp8P56404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aqp8P56404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aqp8P56404 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aqp8P56404 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aqp8P56404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aqp8P56404 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aqp8P56404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aqp8P56404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aqp8P56404 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Aqp8P56404 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aqp8P56404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aqp8P56404 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aqp8P56404 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aqp8P56404 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aqp8P56404 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aqp8P56404 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aqp8P56404 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aqp8P56404 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aqp8P56404 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Aqp8P56404 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Aqp8P56404 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aqp8P56404 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aqp8P56404 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aqp8P56404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aqp8P56404 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aqp8P56404 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aqp8P56404 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aqp8P56404 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aqp8P56404 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aqp8P56404 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 857 ms