RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 COL4A2P08572 1712 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 COLCA2A8K830 154 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 OIP5O43482 229 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 HEXAP06865 529 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 TPT1P13693 172 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 BAP18Q8IXM2 172 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CA13Q8N1Q1 262 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 FBXO17Q96EF6 278 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 INTS14Q96SY0 518 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MMP26Q9NRE1 261 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa18.45■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 DCDC2BA2VCK2 349 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 OR10H2O60403 315 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CRHP06850 196 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 ST6GAL1P15907 406 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 PPICP45877 212 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 ENPP2Q13822 863 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CDNFQ49AH0 187 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 PGAP1Q75T13 922 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 NKD1Q969G9 470 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CMBLQ96DG6 245 aa18.44■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MSGN1A6NI15 193 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB7A8K855 629 aa18.44■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 GPR18Q14330 331 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 SHHQ15465 462 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CST6Q15828 149 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 C2orf27AQ580R0 203 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MDGA2Q7Z553 956 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 RTN4RL2Q86UN3 420 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 RNF141Q8WVD5 230 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 FAM3CQ92520 227 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 VSTM2LQ96N03 204 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MMP25Q9NPA2 562 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 GRHPRQ9UBQ7 328 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MYO9BQ13459 2157 aa18.44■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 URADA6NGE7 173 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 H0YIZ8 118 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 SQSTM1Q13501 440 aa18.43■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa18.43■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 ASB5Q8WWX0 329 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 GDE1Q9NZC3 331 aa18.43■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 C5orf51A6NDU8 294 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CA3P07451 260 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CTSBP07858 339 aa18.42■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.42■□□□□ 0.54
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PMS1-222ENST00000639501 DHDHQ9UQ10 334 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 K7EQS6 105 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 HCRTR1O43613 425 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 ZNF806P0C7X5 589 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 AKR1C3P42330 323 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 CCR4P51679 360 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 SPOCK1Q08629 439 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 SLC17A1Q14916 467 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 FJX1Q86VR8 437 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 PARGQ86W56 976 aa18.42■□□□□ 0.54
PMS1-222ENST00000639501 MISPQ8IVT2 679 aa18.42■□□□□ 0.54
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