RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	CD300A	Q9UGN4	299 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PLSCR5	A0PG75	271 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383		H3BSA7	217 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	IMPA2	O14732	288 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPRY3	O43610	288 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SLC16A7	O60669	478 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	MPZL1	O95297	269 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SEMG1	P04279	462 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	MSMB	P08118	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ADH4	P08319	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	GAA	P10253	952 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX5B	P10606	129 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	HSD17B1	P14061	328 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ITGA2	P17301	1181 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	LMO4	P61968	165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TEK	Q02763	1124 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRT72	Q14CN4	511 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARL9	Q6T311	187 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ADCK1	Q86TW2	530 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM186	Q96B77	213 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PYURF	Q96I23	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	RERGL	Q9H628	205 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	AURKC	Q9UQB9	309 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CACNG2	Q9Y698	323 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383		V9GYQ6	96 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	UNC119B	A6NIH7	251 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CLDN25	C9JDP6	229 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SOCS2	O14508	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SGCE	O43556	437 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	DOK2	O60496	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBOX5	O94941	541 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	GADD45G	O95257	159 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ABHD16A	O95870	558 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TXNDC12	O95881	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PCMT1	P22061	227 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TUBG1	P23258	451 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	LIPA	P38571	399 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	HTR5A	P47898	357 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARHGDIA	P52565	204 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	GYS2	P54840	703 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMIM11A	P58511	58 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	MVK	Q03426	396 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PSG7	Q13046	419 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	AQP6	Q13520	282 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	HFE	Q30201	348 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	AVPI1	Q5T686	147 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	OTP	Q5XKR4	325 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	RINL	Q6ZS11	566 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCL17	Q92583	94 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDRT15	Q96T59	188 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	NUAK2	Q9H093	628 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SMARCA2-262	ENST00000637383	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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