RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC35E1Q96K37 410 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ACP6Q9NPH0 428 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 MMP26Q9NRE1 261 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CLN6Q9NWW5 311 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CELA1Q9UNI1 258 aa3.71□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 VPS8Q8N3P4 1428 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 EFCAB5A4FU69 1503 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0G2JN53 185 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1B0GW55 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TSPAN11A1L157 253 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 OR6C74A6NCV1 312 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF726A6NNF4 738 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 A8MU10 97 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 F6UB75 175 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CT45A6P0DMU7 189 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CT45A5P0DMU8 189 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CT45A7P0DMV0 189 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CCL2P13500 99 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CCR8P51685 355 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TNNC1P63316 161 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TSC22D1Q15714 1073 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 VAMP3Q15836 100 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 GABRA6Q16445 453 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 LCN12Q6JVE5 192 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SNX20Q7Z614 316 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 RDH5Q92781 318 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CD209Q9NNX6 404 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TREM1Q9NP99 234 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 XCL2Q9UBD3 114 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX4Q9UBX2 424 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ATRXP46100 2492 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0B4J2A0 478 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ERICH2A1L162 156 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC22A20A6NK97 555 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 PLPP1O14494 284 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC19A2O60779 497 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 FKBP6O75344 327 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 MOSP00540 346 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 INSP01308 110 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 FOLR1P15328 257 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 LCN1P31025 176 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 NUDT1P36639 197 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 RFC3P40938 356 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CSKP41240 450 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 NOVP48745 357 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 PSMC5P62195 406 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TWF1Q12792 350 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 UNC119Q13432 240 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 GGTLC2Q14390 218 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR176Q14439 515 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 CLINT1Q14677 625 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 COMTD1Q86VU5 262 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ACER1Q8TDN7 264 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 SH3GL3Q99963 347 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.69□□□□□ -1.82
SMARCA2-241ENST00000635397 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms