RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558335.5

GABPB1-207, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene GABPB1, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-207ENST00000558335 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MIB2Q96AX9 1013 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CTHRC1Q96CG8 243 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 FOXN4Q96NZ1 517 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 OR2A5Q96R48 311 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PHB2Q99623 299 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 GABRG3Q99928 467 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 DDA1Q9BW61 102 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 BEX2Q9BXY8 128 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CHST5Q9GZS9 411 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 C20orf85Q9H1P6 137 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MTG2Q9H4K7 406 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 FBXO34Q9NWN3 711 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PLEK2Q9NYT0 353 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CKLFQ9UBR5 152 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ICAM5Q9UMF0 924 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 NOTCH4Q99466 2003 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 COL4A2P08572 1712 aa5□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PTPRSQ13332 1948 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 A0A087WUJ7 227 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 A0A0G2JN53 185 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 A0A1B0GWA3 101 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 A0A1W2PP55 124 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 COLCA2A8K830 154 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CDC42EP2O14613 210 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CCSO14618 274 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 P2RX6O15547 441 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CDC14BO60729 498 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 NCR1O76036 304 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 PPP1R3DO95685 299 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 TXNDC12O95881 172 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MT-ATP6P00846 226 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 IFNA21P01568 189 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 SYPP08247 313 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CYC1P08574 325 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 MELTFP08582 738 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 LINC00271P0C7V0 271 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ABOP16442 354 aa4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 SOX18P35713 384 aa4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 ZNF85Q03923 595 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 FAM53BQ14153 422 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CRMP1Q14194 572 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 SLC10A1Q14973 349 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 SLC36A2Q495M3 483 aa4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.99□□□□□ -1.61
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GABPB1-207ENST00000558335 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 COMMD2Q86X83 199 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 LRRC18Q8N456 261 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 TMEM99Q8N816 258 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.99□□□□□ -1.61
GABPB1-207ENST00000558335 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.99□□□□□ -1.61
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