RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 JKAMPQ9P055 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 CRYAAP02489 173 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 PYCR1P32322 319 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SELENOVP59797 346 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ACTA2P62736 377 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RAB1AP62820 205 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ACTG2P63267 376 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RUNX1T1Q06455 604 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 FMODQ06828 376 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RAB40BQ12829 278 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR52N5Q8NH56 324 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 FAM222BQ8WU58 562 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 THEM6Q8WUY1 208 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SNX33Q8WV41 574 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 NRG4Q8WWG1 115 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 S100PBPQ96BU1 408 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RNFT2Q96EX2 444 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 TEAD3Q99594 435 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 MROQ9BYG7 248 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 WDR76Q9H967 626 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 CDH20Q9HBT6 801 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 AKAP6Q13023 2319 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 DAPL1A0PJW8 107 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR6C6A6NF89 314 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SGCEO43556 437 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ENTPD6O75354 484 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 KRT8P05787 483 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 GYPBP06028 91 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 LYNP07948 512 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ITGA5P08648 1049 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 H2BFMP0C1H6 154 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR2T7P0C7T2 308 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 MYF6P23409 242 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 CDAP32320 146 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 CXCR4P61073 352 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 FAM27E3Q08E93 113 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 GABRA6Q16445 453 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 KCNMB1Q16558 191 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF627Q7L945 461 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 KRT77Q7Z794 578 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF786Q8N393 782 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ACBD4Q8NC06 268 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 OR2T27Q8NH04 317 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 NINJ1Q92982 152 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 COPS4Q9BT78 406 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-218ENST00000550159 NIPAL2Q9H841 368 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms