RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520721.1

IGHV3-22-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-22, Length 359 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-22-201ENST00000520721 SYT4Q9H2B2 425 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 TREM2Q9NZC2 230 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 CACNG2Q9Y698 323 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 MT-ND5P03915 603 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 USP51Q70EK9 711 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ADCK1Q86TW2 530 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR52J3Q8NH60 311 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 DECR2Q9NUI1 292 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 UNC119BA6NIH7 251 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 SGCEO43556 437 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC16A7O60669 478 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 MPZL1O95297 269 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 MSMBP08118 114 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ITGA2P17301 1181 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 LIPAP38571 399 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 GYS2P54840 703 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 TEKQ02763 1124 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 PSG7Q13046 419 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 AQP6Q13520 282 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 KCNMB1Q16558 191 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM186Q96B77 213 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 NUAK2Q9H093 628 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 POFUT1Q9H488 388 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-22-201ENST00000520721 PLSCR5A0PG75 271 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR6C6A6NF89 314 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SOCS2O14508 198 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARPC2O15144 300 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SPRY3O43610 288 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 DOK2O60496 412 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 GMNNO75496 209 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 UBOX5O94941 541 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 GADD45GO95257 159 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 CD55P08174 381 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 TUBG1P23258 451 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARHGDIAP52565 204 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 KRT72Q14CN4 511 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SPRNQ5BIV9 151 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 OTPQ5XKR4 325 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARL9Q6T311 187 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 CDRT15Q96T59 188 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 AURKCQ9UQB9 309 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 V9GYQ6 96 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 DCTN6O00399 190 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ABHD16AO95870 558 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 PCMT1P22061 227 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HTR5AP47898 357 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 RPS6KA3P51812 740 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SMIM11AP58511 58 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HIST1H3AP68431 136 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 MVKQ03426 396 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 CDK5R2Q13319 367 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HFEQ30201 348 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 RFX4Q33E94 735 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 AVPI1Q5T686 147 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-22-201ENST00000520721 TSSK2Q96PF2 358 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms