RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 KLBQ86Z14 1044 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 HSD17B8Q92506 261 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC7A6Q92536 515 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 GNG8Q9UK08 70 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MYL12BO14950 172 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PSMB9P28065 219 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB39AQ14964 217 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SPHARQ15513 63 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CDONQ4KMG0 1287 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF843Q8N446 348 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PRR7Q8TB68 274 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SNX33Q8WV41 574 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MND1Q9BWT6 205 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CENPMQ9NSP4 180 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 TMEM129A0AVI4 362 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 DOK2O60496 412 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ABHD16AO95870 558 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CRHP06850 196 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF32P17041 273 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 LIPAP38571 399 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 WNT4P56705 351 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ACTC1P68032 377 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ACTA1P68133 377 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SVOPQ8N4V2 548 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PELI1Q96FA3 418 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OPALINQ96PE5 141 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CD8BP10966 210 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NPR2P20594 1047 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF774Q6NX45 483 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NAA40Q86UY6 237 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR52N5Q8NH56 324 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RND1Q92730 232 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RORBQ92753 470 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MGLLQ99685 303 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ESPL1Q14674 2120 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 A6NHS1 94 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PNPP00491 289 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 DBHP09172 617 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CST2P09228 141 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PSG4Q00888 419 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM27E3Q08E93 113 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 GABRA6Q16445 453 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 TIGD6Q17RP2 521 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 LIPNQ5VXI9 398 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF627Q7L945 461 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR52N1Q8NH53 320 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 COG8Q96MW5 612 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 OR8B4Q96RC9 309 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 LRP12Q9Y561 859 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CHD6Q8TD26 2715 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 C5orf63A6NC05 138 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms