RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516328.1

RNU6-1338P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1338, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1338P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1338P-201ENST00000516328 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR5H1A6NKK0 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CHADO15335 359 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR7C2O60412 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PLIN3O60664 434 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TM7SF2O76062 418 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 S1PR2O95136 353 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 LYNX1P0DP58 116 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OPRD1P41143 372 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PRMT2P55345 433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MESDQ14696 234 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PDK1Q15118 436 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 SPC24Q8NBT2 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR11H7Q8NGC8 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 HSFY1Q96LI6 401 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 GPR82Q96P67 336 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR2V2Q96R30 315 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 FBXO8Q9NRD0 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 BFARQ9NZS9 450 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 IL19Q9UHD0 177 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MEMO1Q9Y316 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 HAS3O00219 553 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 IGKV1-39P01597 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 UBE2E1P51965 193 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CDKN2DP55273 166 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 IL5RAQ01344 420 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CLINT1Q14677 625 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CEBPEQ15744 281 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 DGUOKQ16854 277 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TCEAL5Q5H9L2 206 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 H3F3CQ6NXT2 135 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CCDC80Q76M96 950 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TCEAL3Q969E4 200 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TTC25Q96NG3 672 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ATP6V0BQ99437 205 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ZNF302Q9NR11 478 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 DYSFO75923 2080 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 F6UB75 175 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CLDN3O15551 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ZNF208O43345 1280 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 SYNGR2O43760 224 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 RAMP3O60896 148 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CD28P10747 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 RAB3AP20336 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 DNAJB1P25685 340 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 HTR2AP28223 471 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CCR1P32246 355 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CEACAM3P40198 252 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PRDX4Q13162 271 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 DPYSL2Q16555 572 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 LIX1Q8N485 282 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 LINC00469Q8N7U9 141 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 C4orf36Q96KX1 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OMDQ99983 421 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 MICAL3Q7RTP6 2002 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 A0A1W2PNM2 257 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 KRBOX1C9JBD0 128 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CCL21O00585 134 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 PRKAB2O43741 272 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 OR7A10O76100 309 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CTSLP07711 333 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 CD1CP29017 333 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 HSD17B2P37059 387 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 ENPP6Q6UWR7 440 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1338P-201ENST00000516328 FAM131AQ6UXB0 335 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms