RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 FCRLAQ7L513 359 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM123Q8N131 208 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 GPR148Q8TDV2 347 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ST7LQ8TDW4 575 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 WDFY2Q96P53 400 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MRI1Q9BV20 369 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 NELFAQ9H3P2 528 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CD8B2A6NJW9 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 KLK10O43240 276 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 DHHO43323 396 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RAMP1O60894 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZFPL1O95159 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 IGHG3P01860 377 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ISG15P05161 165 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 H2BFMP0C1H6 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CD8BP10966 210 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MSR1P21757 451 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CTSSP25774 331 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 STARP49675 285 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 PPP5CP53041 499 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.342e-9■■■■□ 23.8
SEC31A-241ENST00000515749 DDI2Q5TDH0 399 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 C16orf87Q6PH81 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RPTNQ6XPR3 784 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 AAED1Q7RTV5 226 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 GJC3Q8NFK1 279 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MAP6Q96JE9 813 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CEP19Q96LK0 163 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 C4orf45Q96LM5 186 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 CMTM3Q96MX0 182 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 HES7Q9BYE0 225 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SLITRK2Q9H156 845 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 TPK1Q9H3S4 243 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 LDAHQ9H6V9 325 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 BCO1Q9HAY6 547 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 POLE4Q9NR33 117 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 GLRX2Q9NS18 164 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 DKK4Q9UBT3 224 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 R4GMQ9 66 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1B0GVC2 190 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms