RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A8MXE2 369 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FCMRO60667 390 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NDUFB2O95178 105 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PMS2P2O95744 297 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ACVR1BP36896 505 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MEOX2P50222 304 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FUT7Q11130 342 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MALLQ13021 153 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ACTBL2Q562R1 376 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TEX261Q6UWH6 196 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMUB2Q71RG4 321 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NRMQ8IXM6 262 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CENPOQ9BU64 300 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MED18Q9BUE0 208 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HRH4Q9H3N8 390 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TCFL5Q9UL49 500 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 U3KQ87 197 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MED6O75586 246 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EPHA2P29317 976 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SOX2P48431 317 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CD81P60033 236 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RANP62826 216 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 IL13RA1P78552 427 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SORDQ00796 357 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SSX8Q7RTT4 187 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NANPQ8TBE9 248 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CT55Q8WUE5 264 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR5B2Q96R09 309 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MFRPQ9BY79 579 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 V9GY05 133 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SPTBN2O15020 2390 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GABRPO00591 440 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GAAP10253 952 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RAB6AP20340 208 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC25A45Q8N413 288 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NUBPLQ8TB37 319 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CDH20Q9HBT6 801 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 INIPQ9NRY2 104 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RCE1Q9Y256 329 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CEP350Q5VT06 3117 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 POM121CA8CG34 1229 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 J3QR89 54 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CBR3O75828 277 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 IL2RAP01589 272 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ADH7P40394 386 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GABRA4P48169 554 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 P2RX1P51575 399 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CXADRP78310 365 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 VWA2Q5GFL6 755 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GRINAQ7Z429 371 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GALNT16Q8N428 558 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR6S1Q8NH40 331 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C14orf79Q96F83 325 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 VSTM2LQ96N03 204 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ETV7Q9Y603 341 aa6.95□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 BPTFQ12830 3046 aa6.94□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C20orf202A1L168 122 aa6.94□□□□□ -1.3
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