RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 GADD45GO95257 159 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TXNDC12O95881 172 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 NGFP01138 241 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GAAP10253 952 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CRABP1P29762 137 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IFNGR2P38484 337 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RPS6KA3P51812 740 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MNAT1P51948 309 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SLC3A1Q07837 685 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CCNIQ14094 377 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 KCNMB1Q16558 191 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 HFEQ30201 348 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RFX4Q33E94 735 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MESTQ5EB52 335 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 FGD3Q5JSP0 725 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 USP51Q70EK9 711 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ADCK1Q86TW2 530 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PHC2Q8IXK0 858 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TEX29Q8N6K0 151 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ABHD4Q8TB40 342 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PTP4A1Q93096 173 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM186Q96B77 213 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TIMD4Q96H15 378 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CDRT15Q96T59 188 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 FUZQ9BT04 418 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 FAM107BQ9H098 131 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 NDE1Q9NXR1 346 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TREM2Q9NZC2 230 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 METRNQ9UJH8 293 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 FAM157AC9JC47 383 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CLDN25C9JDP6 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 H7C1C5 153 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SOCS2O14508 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 WNT9BO14905 357 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ARPC3O15145 178 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SPRY3O43610 288 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IDH3BO43837 385 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DCTN3O75935 186 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 KRT36O76013 467 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 UBOX5O94941 541 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DIRAS1O95057 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ABHD16AO95870 558 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV1-46P01743 117 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MSMBP08118 114 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CD55P08174 381 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CTLA4P16410 223 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GSTM3P21266 225 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TNFSF4P23510 183 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MPV17P39210 176 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 HTR5AP47898 357 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RGS6P49758 472 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 HMGA2P52926 109 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LCN6P62502 163 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PSG7Q13046 419 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SCGB2A2Q13296 93 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CDK5R2Q13319 367 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 AQP6Q13520 282 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SEC23BQ15437 767 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MTX3Q5HYI7 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf89Q6UX73 402 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RNF148Q8N7C7 305 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GJC3Q8NFK1 279 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OR52J3Q8NH60 311 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OR51F2Q8NH61 342 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CCL17Q92583 94 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RASD2Q96D21 266 aa6.19□□□□□ -1.42
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