RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428313.5

C9orf3-206, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-206ENST00000428313 PET100P0DJ07 73 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 NR2C1P13056 603 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 TIMP2P16035 220 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 MC3RP41968 323 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SSR2P43308 183 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 FHL1Q13642 323 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 FAM166AQ6J272 317 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF529Q6P280 563 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 Q6ZVL8 140 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 MCHR2Q969V1 340 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM106AQ96A25 262 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 PRODH2Q9UF12 536 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SYT7O43581 403 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 AIFM1O95831 613 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ID4P47928 161 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 UBE2V2Q15819 145 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 PDE7BQ9NP56 450 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 KLK13Q9UKR3 277 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf3-206ENST00000428313 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 STK17BO94768 372 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CKMP06732 381 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ELNP15502 786 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 IL2RGP31785 369 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.096e-13■■■□□ 15
C9orf3-206ENST00000428313 FAM3AP98173 230 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF627Q7L945 461 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 MVB12AQ96EY5 273 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CERS4Q9HA82 394 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RAB18Q9NP72 206 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 GLOD5A6NK44 160 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM212A6NML5 194 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RAB6AP20340 208 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 IGFALSP35858 605 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 TSPAN7P41732 249 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CLDN2P57739 230 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 DUSP5Q16690 384 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CARFQ8N187 725 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 TERB2Q8NHR7 220 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 A0A087WWC5 75 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 PSMD9O00233 223 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 NDUFB2O95178 105 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 LAMP2P13473 410 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 FABP4P15090 132 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CHATP28329 748 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 SLC9A5Q14940 896 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF563Q8TA94 476 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 IL17FQ96PD4 163 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 KCNK15Q9H427 330 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 A0A1B0GW64 132 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 SMCO3A2RU48 225 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 RAB27BO00194 218 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 DVL1O14640 695 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 EREGO14944 169 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 BRINP1O60477 761 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf3-206ENST00000428313 JTBO76095 146 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms