RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.54□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN20P56880 219 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.53□□□□□ -1.84
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