RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
C6orf48-208ENST00000395788 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.34□□□□□ -1.55
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C6orf48-208ENST00000395788 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 ISPDA4D126 451 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 OR5H15A6NDH6 313 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM212A6NML5 194 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF716A6NP11 495 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 THBS2P35442 1172 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 BCL2A1Q16548 175 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 MEP1BQ16820 701 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 TMEM225Q6GV28 225 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 SULF2Q8IWU5 870 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 MCHR2Q969V1 340 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 OR2M2Q96R28 347 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 EMC6Q9BV81 110 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 MROQ9BYG7 248 aa5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 RCE1Q9Y256 329 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 CMAHPQ9Y471 501 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 V9GYH0 126 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.33□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.32□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF879B4DU55 563 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 GPR171O14626 319 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 TNFSF11O14788 317 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 CASKO14936 926 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 UPK1BO75841 260 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 MPZL1O95297 269 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 PNPP00491 289 aa5.32□□□□□ -1.56
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DQA2P01906 255 aa5.32□□□□□ -1.56
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C6orf48-208ENST00000395788 SPARCP09486 303 aa5.32□□□□□ -1.56
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