RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 TMED7Q9Y3B3 224 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 C17orf51A8MQB3 221 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MOSPD3O75425 235 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ADAP1O75689 374 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CAMLGP49069 296 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 GPR85P60893 370 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 BATF2Q8N1L9 274 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 RLN3Q8WXF3 142 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MEMO1Q9Y316 297 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 EFCAB7A8K855 629 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 WDPCPO95876 746 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PNMTP11086 282 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ACKR1Q16570 336 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 BCORP1Q8N888 145 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ISOC2Q96AB3 205 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 AMELYQ99218 206 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 RAB19A4D1S5 217 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ADAM11O75078 769 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 B3GALNT1O75752 331 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 APOC1P02654 83 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 NAT2P11245 290 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ADH6P28332 368 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 SDHAP31040 664 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF529Q6P280 563 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PHYHIPQ92561 330 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 BADQ92934 168 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 COX14Q96I36 57 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 HDAC8Q9BY41 377 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 SLC35E2P0CK97 266 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CPN1P15169 458 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CLINT1Q14677 625 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 OR2A5Q96R48 311 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 STACQ99469 402 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CDC6Q99741 560 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF649Q9BS31 505 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 EHFQ9NZC4 300 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 NME2P1O60361 137 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 SNAPC5O75971 98 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PSMB6P28072 239 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 NTSR1P30989 418 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 FCRL6Q6DN72 434 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MRGPREQ86SM8 312 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 BAP18Q8IXM2 172 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 MAP3K3Q99759 626 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 RSRP1Q9BUV0 290 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 SCPEP1Q9HB40 452 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0J9YY10 115 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 F5H5K5 113 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 WNT11O96014 354 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OMGP23515 440 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 HNF4GQ14541 408 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR51T1Q8NGJ9 327 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 LMX1AQ8TE12 382 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 JAM3Q9BX67 310 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 MED29Q9NX70 200 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 KLRF1Q9NZS2 232 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 BCL2L11O43521 198 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PTP4A3O75365 173 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR2F2O95006 317 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 UTS2O95399 124 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CTSBP07858 339 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 GABRR1P24046 479 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SFTPDP35247 375 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PSG6Q00889 435 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR2F1Q13607 317 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SPIN3Q5JUX0 258 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SLC35D3Q5M8T2 416 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms