RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gnb3Q61011 340 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r83Q8R287 306 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Q9D1Z2 194 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Jag2Q9QYE5 1247 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 TfecQ9WTW4 317 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 ClcnkaQ9WUB7 687 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Esp8F7AMQ8 149 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dbil5O09035 87 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tcstv3O70518 169 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tead1P30051 426 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Htr5aP30966 357 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dlx2P40764 332 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prss34Q80UR4 318 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp459Q8BZ17 267 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Iglon5Q8HW98 336 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cwh43Q91YL7 699 aa16■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm20431E9PY39 371 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 4933403O08RikF6UK53 379 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dgcr2P98154 548 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Crebl2Q32M00 123 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 ApoolQ78IK4 265 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Scml4Q80VG1 408 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem184bQ8BG09 407 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mblac1Q8BWY4 260 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ubqln3Q8C5U9 658 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 HaghQ99KB8 309 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn2r113E9PZA6 856 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prr22F6TNE3 422 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kcng2F7A6P6 480 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Casp6O08738 276 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gfra2O08842 464 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Nfatc1O88942 717 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Il7rP16872 459 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adamts8P57110 905 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Doc2bP70169 412 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc19a3Q99PL8 488 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr44Q9EQB8 314 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr64F8VPZ8 307 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r94K7N6X3 305 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 HexbP20060 536 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ube2kP61087 200 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ubtd2Q6PGH0 234 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 HeltQ7TS99 240 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr167Q8VGJ5 312 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dusp3Q9D7X3 185 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Keg1Q9DCY0 295 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 LipgQ9WVG5 500 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dpy19l1A6X919 746 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1218L7MU54 311 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr224M9MMJ7 314 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 RelP15307 587 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Srp9P49962 86 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Taar8bQ5QD06 344 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adgrd1Q80T32 903 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm9999Q8C5Y2 53 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a34A2ADF7 318 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm14418A2ARR6 358 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm14322A2AW66 358 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mptx2D3YYJ7 219 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Stfa1P35175 97 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 GdnfP48540 211 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sim2Q61079 657 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc46a3Q9DC26 460 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gstk1Q9DCM2 226 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Aloxe3Q9WV07 711 aa15.99■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1157A2AVC4 312 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn2r82G3UWA2 865 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gpr3P35413 330 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1501Q8VFQ3 315 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr410Q8VFX7 315 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr402Q8VFX8 315 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Thyn1Q91YJ3 226 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 NpvfQ9ESQ8 188 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Six6Q9QZ28 246 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Alkal1J3QPP8 127 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dscr3O35075 297 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 AF067061O70616 171 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ccl5P30882 91 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Yif1bQ9CX30 311 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 CtszQ9WUU7 306 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Timm8a1Q9WVA2 97 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prl8a2O54832 240 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tacr3P47937 452 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tnfsf10P50592 291 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rac2Q05144 192 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 CcsapQ8QZT2 252 aa15.98■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tubd1Q9R1K7 455 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms