RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	ACTA2	P62736	377 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ACTG2	P63267	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ACTC1	P68032	377 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ACTA1	P68133	377 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IRF4	Q15306	451 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	BMF	Q96LC9	184 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RLF	Q13129	1914 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CHD4	Q14839	1912 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		F6UB75	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	WRB	O00258	174 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DPM1	O60762	260 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CLDN11	O75508	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ANXA5	P08758	320 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DCK	P27707	260 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CDKN2B	P42772	138 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CDKN1B	P46527	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PPOX	P50336	477 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LIPE	Q05469	1076 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LRRC63	Q05C16	580 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MAB21L1	Q13394	359 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NCF4	Q15080	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		Q6ZVH6	145 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PRELID2	Q8N945	189 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	VCX	Q9H320	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830		H0YIV9	168 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FKBP6	O75344	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CTAG2	O75638	210 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RP2	O75695	350 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	GNAO1	P09471	354 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CLDN18	P56856	261 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	REG3A	Q06141	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TRAM2	Q15035	370 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PQLC3	Q8N755	202 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	GCNT4	Q9P109	453 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CTSF	Q9UBX1	484 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CD5L	O43866	347 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	FABP3	P05413	133 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	OR5H8	P0DN80	308 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	RAB3A	P20336	220 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	CEACAM6	P40199	344 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	MAGEA1	P43355	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	SP4	Q02446	784 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	PSMD5	Q16401	504 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-208	ENST00000563830	ARL9	Q6T311	187 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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