RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CD79BP40259 229 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EGR3Q06889 387 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ST3GAL4Q11206 333 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF544Q6NX49 715 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OTOSQ8NHW6 89 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FCGR1BQ92637 280 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 GGHQ92820 318 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TSSK2Q96PF2 358 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SP140LQ9H930 580 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PRSS50Q9UI38 385 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NBASA2RRP1 2371 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TMEM129A0AVI4 362 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 C16orf97H3BN30 126 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 IGHV3-9P01782 118 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TFP02787 698 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 LYNP07948 512 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ITGA5P08648 1049 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CLUP10909 449 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 IGHV1-2P23083 117 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DCTDP32321 178 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 PLP2Q04941 152 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ETFDHQ16134 617 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 SYS1Q8N2H4 156 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 MROQ9BYG7 248 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TVP23AA6NH52 213 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 XPNPEP2O43895 674 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 KRT8P05787 483 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 COX5BP10606 129 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 B4GALT1P15291 398 aa8.17□□□□□ -1.1
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