RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 DLL4Q9NR61 685 aa7.58□□□□□ -1.2
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ITGB1-217ENST00000494395 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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ITGB1-217ENST00000494395 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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ITGB1-217ENST00000494395 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 GIPC3Q8TF64 312 aa7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 TSSK2Q96PF2 358 aa7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 FEVQ99581 238 aa7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.56□□□□□ -1.2
ITGB1-217ENST00000494395 IFT27Q9BW83 186 aa7.56□□□□□ -1.2
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