RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ROM1Q03395 351 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FMODQ06828 376 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST3H3Q16695 136 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PCK2Q16822 640 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPNQ5VXI9 398 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRLAQ7L513 359 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT77Q7Z794 578 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 AP3S1Q92572 193 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MCHR2Q969V1 340 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRG7Q96K78 797 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 UCN2Q96RP3 112 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FRYLO94915 3013 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPL8 197 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN25C9JDP6 229 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YC42 278 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD9O00233 223 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC43A1O75387 559 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM4O75871 244 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL6IP5O75915 188 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GPANK1O95872 356 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMB10P40306 273 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MTNR1BP49286 362 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LHX2P50458 406 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 BMXP51813 675 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SRYQ05066 204 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF846Q147U1 533 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MEP1BQ16820 701 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPTNQ6XPR3 784 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TPRA1Q86W33 373 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX19Q8NA77 164 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8B4Q96RC9 309 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD6Q9BV23 337 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK13Q9UKR3 277 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RCE1Q9Y256 329 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MPDZO75970 2070 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CD8B2A6NJW9 211 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM212A6NML5 194 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CYTIPO60759 359 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 UPK3AO75631 287 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MPZL1O95297 269 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CELA3AP09093 270 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CD8BP10966 210 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF708P17019 499 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL9P24844 172 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF84P51523 738 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR9P51686 369 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MXD1Q05195 221 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 INAQ16352 499 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNMB1Q16558 191 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRILQ7L0X0 811 aa8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms