RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 OR2T4Q8NH00 348 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TAAR8Q969N4 342 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 UPRTQ96BW1 309 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.95□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CACNA1CQ13936 2221 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM129A0AVI4 362 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 GPR31O00270 319 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PLA2G10O15496 165 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CRYBB2P43320 205 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 IKZF1Q13422 519 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PIGQQ9BRB3 760 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 RAD1O60671 282 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 HNF1AP20823 631 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CXCR1P25024 350 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CRABP1P29762 137 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM205Q6UW68 189 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 OR5W2Q8NH69 310 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 Q96M85 177 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ADAM19Q9H013 955 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PQD3 144 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SMIM30A4D0T7 59 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 AKR7A3O95154 331 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 IGHA1P01876 353 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 UMODP07911 640 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 NMBP08949 121 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 FGF2P09038 288 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ACP1P24666 158 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ETV6P41212 452 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CCR6P51684 374 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 RPS25P62851 125 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 INSL4Q14641 139 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 KLBQ86Z14 1044 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PRO1933Q9H354 126 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 MYOTQ9UBF9 498 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 A0A087X0M5 115 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1B0GX30 115 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 IRGMA1A4Y4 181 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 J3QRE1 110 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PHYHO14832 338 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ONECUT2O95948 504 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CELP19835 753 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 MXD1Q05195 221 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 NUBPLQ8TB37 319 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 THAP6Q8TBB0 222 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TSSK2Q96PF2 358 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 VDAC3Q9Y277 283 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 V9GYH0 126 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CPEP16870 476 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 PGCP20142 388 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SLC2A5P22732 501 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 SLC6A8P48029 635 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 P2RX1P51575 399 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 CBFBQ13951 182 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 OPCMLQ14982 345 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 C22orf42Q6IC83 251 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF561Q8N587 486 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms