RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 GAAP10253 952 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 COX4I1P13073 169 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 LAP3P28838 519 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MPV17P39210 176 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 PLP2Q04941 152 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SGCAQ16586 387 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRNQ5BIV9 151 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 THEM4Q5T1C6 240 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1J1Q8NGS3 322 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2H1Q9GZK4 316 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.05□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1-46P01743 117 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 CST2P09228 141 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HNF1AP20823 631 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 LSP1P33241 339 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 APLNRP35414 380 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 GSK3BP49841 420 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVK-25P63136 954 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAM2Q15035 370 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 PCGF3Q3KNV8 242 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM122BQ7Z309 247 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM186Q96B77 213 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RBP7Q96R05 134 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 G6PC2Q9NQR9 355 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.04□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf49A4QMS7 147 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 IMPA2O14732 288 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 UBOX5O94941 541 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TFP02787 698 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 IFNW1P05000 195 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MSMBP08118 114 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ADH4P08319 380 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNOP22674 350 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A2P52569 658 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 FXYD6P3P58550 94 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SELENOVP59797 346 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HSF2Q03933 536 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 CD47Q08722 323 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATA46Q5T0L3 261 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF774Q6NX45 483 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 OAFQ86UD1 273 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 C7orf34Q96L11 122 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 FUZQ9BT04 418 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 POFUT1Q9H488 388 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 POLE4Q9NR33 117 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR160Q9UJ42 338 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.03□□□□□ -0.8
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 H7C1C5 153 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 VENTXO95231 258 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 SERPINA1P01009 418 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 CD14P08571 375 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 NCK1P16333 377 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 LIMS1P48059 325 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC9A3P48764 834 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 LCN6P62502 163 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 MVKQ03426 396 aa10.02□□□□□ -0.81
CLSTN3-211ENST00000541667 GLO1Q04760 184 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms