RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 XRCC2O43543 280 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 CALCBP10092 127 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 RPA2P15927 270 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 IL13RA1P78552 427 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 RAB35Q15286 201 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 Q499Y3 187 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 GPRIN2O60269 458 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 PMP2P02689 132 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 FABP1P07148 127 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 GSG1Q2KHT4 349 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM215Q68D42 235 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.62□□□□□ -1.03
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