RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC7A4O43246 635 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SCELO95171 688 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 FSTL3O95633 263 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGF1P05019 195 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTGFRP43088 359 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRLHRP49683 370 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCR8P51685 355 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCL23P55773 120 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLDN6P56747 220 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CRADDP78560 199 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 IL5RAQ01344 420 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 MAB21L1Q13394 359 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC15A2Q16348 729 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SP6Q3SY56 376 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR2G6Q5TZ20 316 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARL9Q6T311 187 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM159AQ6UWV7 190 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 DLEU7Q6UYE1 221 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SNX20Q7Z614 316 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SERPINA12Q8IW75 414 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC6A7Q99884 636 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 FTHL17Q9BXU8 183 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 RHOJQ9H4E5 214 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 C8orf17Q9NRJ1 99 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 CNIH4Q9P003 139 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 STX8Q9UNK0 236 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 AKAP9Q99996 3911 aa-0.59□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-0.6□□□□□ -2.5
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 FRYLO94915 3013 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 COL4A2P08572 1712 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 FMN1Q68DA7 1419 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PNM2 257 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRDCB7Z8K6 153 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CHST10O43529 356 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SYNGR2O43760 224 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CXCL13O43927 109 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 B3GAT3O94766 335 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 NAPSAO96009 420 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGKV1-13P0DP09 117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCDC130P13994 396 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 GZMHP20718 246 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CEACAM6P40199 344 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 GID4Q8IVV7 300 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 EXOC8Q8IYI6 725 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SDR42E1Q8WUS8 393 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 TGM7Q96PF1 710 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 OSBPL10Q9BXB5 764 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM206AQ9NX38 181 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 HOXC10Q9NYD6 342 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 MTCH1Q9NZJ7 389 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAJB9Q9UBS3 223 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 KIAA1257Q9ULG3 409 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 MUC3AQ02505 3323 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SSH2Q76I76 1423 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 A8MWP4 228 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 RS1O15537 224 aa-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RN7SKP19-201ENST00000516016 C1QCP02747 245 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms