RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0G2JK05	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DCTN6	O00399	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CTDSP2	O14595	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DNPH1	O43598	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOF	O60613	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGA10	O75578	1167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LY86	O95711	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT14	O95848	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PTTG1	O95997	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HRG	P04196	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINA7	P05543	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CD37	P11049	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CRABP1	P29762	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PYCR1	P32322	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SSR4	P51571	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A1	P53985	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP3R1	P63098	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CD69	Q07108	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PUDP	Q08623	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ESX1	Q8N693	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GHSR	Q92847	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ATF6B	Q99941	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR76	Q9H967	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MED11	Q9P086	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PI4KA	P42356	2102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PRG6	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		J3QLW9	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	XKRY	O14609	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRTM2	O43300	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC19A2	O60779	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	AQP8	O94778	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TPPP	O94811	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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