RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 RBP7Q96R05 134 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ATF6BQ99941 703 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A087WV48 116 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0U1RQV5 110 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SHISA3A0PJX4 238 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CD8B2A6NJW9 211 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ACOT7O00154 380 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TNFSF11O14788 317 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CTDSPLO15194 276 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF43P17038 809 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RANBP1P43487 201 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GDI2P50395 445 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF846Q147U1 533 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RAET1LQ5VY80 246 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PTX4Q96A99 478 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ABHD6Q9BV23 337 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC32Q9BV29 185 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR10A4Q9H209 315 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 EMC3Q9P0I2 261 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KLK13Q9UKR3 277 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PNR3 127 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ISPDA4D126 451 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GFRA3O60609 400 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GDF1P27539 372 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PYCR1P32322 319 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NTF4P34130 210 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CLDN20P56880 219 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FCRLAQ7L513 359 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SPSB4Q96A44 273 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GFI1Q99684 422 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KCNJ15Q99712 375 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MALT1Q9UDY8 824 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 V9GYH0 126 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 V9GYS6 101 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1B0GWJ7 208 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ARGFXA6NJG6 315 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF879B4DU55 563 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PIN1P1O15428 100 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC16A7O60669 478 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC43A1O75387 559 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ALDOBP05062 364 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MSR1P21757 451 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SOX6P35712 828 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MELKQ14680 651 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TGIF1Q15583 401 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 Q499Y3 187 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL12Q53G59 568 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 HACD4Q5VWC8 232 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 AP3S1Q92572 193 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 POM121Q96HA1 1249 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF75AQ96N20 296 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SFXN2Q96NB2 322 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF292O60281 2723 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF878C9JN71 531 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms