RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 Q96M85 177 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PLK3Q9H4B4 646 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GPR160Q9UJ42 338 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.55□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 ARL9Q6T311 187 aa11.54□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.54□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 CDH20Q9HBT6 801 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.54□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 COX5BP10606 129 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 KRT80Q6KB66 452 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 IL20Q9NYY1 176 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-211ENST00000476336 GNGT2O14610 69 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SYNGR3O43761 229 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SLC16A7O60669 478 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PATE4P0C8F1 98 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 STOMP27105 288 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 ARHGDIAP52565 204 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FXYD6P3P58550 94 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-211ENST00000476336 CHID1Q9BWS9 393 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SYT4Q9H2B2 425 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 POLE4Q9NR33 117 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 GSC2O15499 205 aa11.51□□□□□ -0.57
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