RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PNLIPRP2P54317 469 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB2Q16082 182 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GUCA2BQ16661 112 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN9Q8WX39 176 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DCBLD2Q96PD2 775 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A7Q99884 636 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 VSIG4Q9Y279 399 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TACC2O95359 2948 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP13Q12802 2813 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf63A6NC05 138 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TVP23AA6NH52 213 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COLCA2A8K830 154 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 VSIG8P0DPA2 414 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN1P31025 176 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 THBS4P35443 961 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ART1P52961 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN5P62079 268 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM92Q6UXU6 159 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8H3Q8N146 312 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RIT1Q92963 219 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OMA1Q96E52 524 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0A6YYD4 124 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD5O14737 125 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPC5O15511 151 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CD5P06127 495 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPKBP27987 946 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH3B1P43353 468 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FASLGP48023 281 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B7P56937 341 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ST8SIA6P61647 398 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD2Q14332 565 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC17A1Q14916 467 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL12Q53G59 568 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM225Q6GV28 225 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CACUL1Q86Y37 369 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH26Q8IXH8 852 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ROS1P08922 2347 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PLN8 166 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C1C5 153 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN2O60636 221 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPANK1O95872 356 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHMP01871 453 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NAT2P11245 290 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF35P13682 527 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRA3P34903 492 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LTBRP36941 435 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN6P62502 163 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPM6BQ13491 265 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OTPQ5XKR4 325 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PARM1Q6UWI2 310 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF454Q8N9F8 522 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EDARADDQ8WWZ3 215 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK17Q96T54 332 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAMP1O15126 338 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SDC3O75056 442 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35G6P0C7Q6 338 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP7P18075 431 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST3H3Q16695 136 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10K2Q6IF99 312 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR8Q969N4 342 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0A6YYH2 397 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms