RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 LAP3P28838 519 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 CRABP1P29762 137 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 PCBD1P61457 104 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 HSF2Q03933 536 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 HGFACQ04756 655 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 COX10Q12887 443 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ASRGL1Q7L266 308 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 TMUB1Q9BVT8 246 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 POLE4Q9NR33 117 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.6■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF35P13682 527 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF32P17041 273 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGDIAP52565 204 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP5J2P56134 94 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 GALK2Q01415 458 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 DAG1Q14118 895 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 Q5PR19 223 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 LEG1Q6P5S2 330 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 FBXO17Q96EF6 278 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 FEVQ99581 238 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 WACQ9BTA9 647 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 NUAK2Q9H093 628 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 RERGLQ9H628 205 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.59■□□□□ 0.09
SEMA3B-201ENST00000416295 BHLHE40O14503 412 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NR4A1P22736 598 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SERPINF1P36955 418 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAM8P78325 824 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ETFDHQ16134 617 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 KRT80Q6KB66 452 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 VHLLQ6RSH7 139 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SYT9Q86SS6 491 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR4K13Q8NH42 304 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NMNAT3Q96T66 252 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF556Q9HAH1 456 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.58■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TIPRLO75663 272 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SOX14O95416 240 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SNAP29O95721 258 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR4A8P0C604 315 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 APLNRP35414 380 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CDKN1AP38936 164 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ADIPOQQ15848 244 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LNX2Q8N448 690 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR2T33Q8NG76 320 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NRBF2Q96F24 287 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CACNG6Q9BXT2 260 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CDH20Q9HBT6 801 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 B9A039 149 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 FCGR1AP12314 374 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ANXA8P13928 327 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 THBS4P35443 961 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PSG4Q00888 419 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 GLO1Q04760 184 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CCNIQ14094 377 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 EFNB3Q15768 340 aa15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms