RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 OR9Q2Q8NGE9 314 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1J2Q8NGS2 313 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf198Q9H425 327 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PLK3Q9H4B4 646 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 REEP1Q9H902 201 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CMAHPQ9Y471 501 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 U3KQV3 271 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM129A0AVI4 362 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPC3O15145 178 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A7O60669 478 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GLRXP35754 106 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PSG4Q00888 419 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MICAQ29983 383 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PTCHD4Q6ZW05 846 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCK1Q86TW2 530 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DOK1Q99704 481 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT27Q9BW83 186 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT4Q9H2B2 425 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LRMDAQ9H2I8 198 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RERGLQ9H628 205 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH20Q9HBT6 801 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 POLE4Q9NR33 117 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 VNN3Q9NY84 501 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MED13LQ71F56 2210 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCE1Q9P212 2302 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 DHRS12A0PJE2 317 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRIN2O60269 458 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CTLA4P16410 223 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MSR1P21757 451 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 APLNRP35414 380 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT6P53370 316 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PCBD1P61457 104 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FLOT2Q14254 428 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D28Q2M2D7 210 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA24Q86W54 205 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXN4Q96NZ1 517 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SMR3AQ99954 134 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NUAK2Q9H093 628 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 POMPQ9Y244 141 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf71A8MTZ7 269 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 IDH3BO43837 385 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5HO75947 161 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CST1P01037 141 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 STOMP27105 288 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NOS3P29474 1203 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF2P50749 326 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 EFNA4P52798 201 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MSMPQ1L6U9 139 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SVOPLQ8N434 492 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP11Q8NBQ7 271 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF416Q9BWM5 594 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2H1Q9GZK4 316 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 EGLN3Q9H6Z9 239 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 EMC7Q9NPA0 242 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAP29O95721 258 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM157BP0CG42 384 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNOP22674 350 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD52P43351 418 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 EVX1P49640 407 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 UCP2P55851 309 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 LEG1Q6P5S2 330 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT9Q86SS6 491 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 BIVMQ86UB2 503 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 JAZF1Q86VZ6 243 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 GLB1L2Q8IW92 636 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4K13Q8NH42 304 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TSSK2Q96PF2 358 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 NMNAT3Q96T66 252 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 WACQ9BTA9 647 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT5BQ9H1J7 359 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-204ENST00000416021 IL20Q9NYY1 176 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms