RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cacna1cQ01815 2139 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 OpcmlG5E8G3 345 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfand5O88878 213 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Irs1P35569 1233 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fosl1P48755 273 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ackr3P56485 362 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 SryQ05738 395 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr434Q8VF17 321 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr47Q8VF18 321 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Golga4Q91VW5 2238 aa16.04■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Iglc4A0A0G2JEK5 104 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kcnj1O88335 372 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 PiglQ5SX19 252 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr151Q60893 309 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1167Q7TR26 316 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 FkrpQ8CG64 494 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1378Q8VGH0 315 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Retreg3Q9CQV4 466 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Magt1Q9CQY5 335 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 PolmQ9JIW4 496 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrpl39Q9JKF7 336 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sned1Q70E20 1403 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 MiipA2A7Y5 387 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hoxa9P09631 271 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ypel5P62700 121 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Galnt14Q8BVG5 550 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cdca5Q9CPY3 264 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ceacam13Q9DAT7 263 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Chrm3Q9ERZ3 589 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr655E9Q252 308 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp616J3QN14 987 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Nxph2Q61199 261 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr859Q7TRF5 309 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mlf2Q99KX1 247 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r124D3YTX4 307 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rcor3Q6PGA0 451 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 LcorQ6ZPI3 433 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fate1Q8CEK7 99 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr166Q8VGX2 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem174Q9DCX7 243 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc23a2Q9EPR4 648 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10375L7N286 184 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Phlda2O08969 144 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Lin7bO88951 207 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd1d1P11609 336 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd1d2P11610 336 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 TfptQ3U1J1 259 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zp3rQ60736 579 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Nol4lQ6DIB4 494 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Amer3Q6NS69 780 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prss54Q7M756 383 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ankrd9Q8BH83 326 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr780Q8VEU0 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr796Q8VGJ1 310 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1054Q8VGS7 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tnfsf13Q9D777 241 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hnf4gQ9WUU6 408 aa16.03■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r20K7N778 303 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 LifP09056 203 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcmt1P23506 227 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Drd3P30728 446 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ikzf1Q03267 517 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gpr160Q3U3F9 336 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hapln3Q80WM5 359 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mboat1Q8BH98 492 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Faap24Q8BHL6 221 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1277Q8VF41 303 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1388Q8VFA3 311 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ndufb10Q9DCS9 176 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Smco4Q9JIS3 59 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wif1Q9WUA1 379 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm6569D3YTM9 175 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcdh17E9PXF0 1157 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 NfyaP23708 346 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Klri2Q5DT36 248 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prmt8Q6PAK3 394 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prickle3Q80VL3 624 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp9Q8BIS1 454 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr307Q8VFN8 313 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Syt17Q920M7 470 aa16.02■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 ComtO88587 265 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 GypaP14220 168 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 StsP50427 624 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rps10P63325 165 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 HbegfQ06186 208 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 HgsnatQ3UDW8 656 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tusc1Q673H1 205 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fam234bQ8BYI8 624 aa16.02■□□□□ 0.15
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pqlc3Q8C6U2 202 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.1 ms