RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	ATG19	P35193	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	BUL1	P48524	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	SKY1	Q03656	742 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	HOP1	P20050	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MSS4	P38994	779 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	GCV2	P49095	1034 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	TFC6	Q06339	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ASI2	P53895	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	UBX4	P54730	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	TPO1	Q07824	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PFA3	P42836	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	NPY1	P53164	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	STP4	Q07351	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RMP1	Q12530	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	CMP2	P14747	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	LRG1	P35688	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	TDA3	P38758	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RSM24	Q03976	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PHM6	Q05637	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PRC1	P00729	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	HIS5	P07172	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
DSS1	YMR287C	YKU70	P32807	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	SIC1	P38634	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MAD2	P40958	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	QRI7	P43122	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	SSY5	P47002	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	CRR1	Q05790	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PEX15	Q08215	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
DSS1	YMR287C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YHR078W	P38799	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MEF2	P39677	819 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	SPC105	P53148	917 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	LAM1	P38851	1228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	KTR4	P38131	464 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	CDS1	P38221	457 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	EAF5	P39995	279 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YDL183C	P48569	320 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	DIN7	Q12086	430 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ENA1	P13587	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SEC65	P29478	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	HXT4	P32467	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YHR112C	P38716	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YHR202W	P38887	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	HLR1	Q04429	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SGD1	Q06132	899 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MLC2	Q06580	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	OMS1	Q06668	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	CDC20	P26309	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	PTP2	P29461	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	LST4	P34239	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	VHR1	P40522	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	VID28	P40547	921 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ATG16	Q03818	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	THI80	P35202	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	CTF13	P35203	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	EXG2	P52911	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	CDA2	Q06703	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	COQ2	P32378	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	EXO84	P38261	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	BUD8	P41698	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SHR5	P41912	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ROT1	Q03691	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	MED7	Q08278	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	YKL222C	P35995	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SAK1	P38990	1142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	BAP3	P41815	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	SLD3	P53135	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSS1	YMR287C	ORC4	P54791	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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