RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SPACA7	Q96KW9	195 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF24	Q9UPV7	400 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CUX1	P39880	1505 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ERBB4	Q15303	1308 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMC2	Q13753	1193 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF34	Q969K3	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GML	Q99445	158 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TREH	O43280	583 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	TNNI2	P48788	182 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNQ4	P56696	695 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	AAMP	Q13685	434 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	STRN4	Q9NRL3	753 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	EPB42	P16452	691 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FGFR3	P22607	806 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RBL2	Q08999	1139 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR152	Q8TDT2	470 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	IRF7	Q92985	503 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FZD6	O60353	706 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GAS6	Q14393	721 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	EDEM1	Q92611	657 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PPME1	Q9Y570	386 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNJ1	O43426	1573 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT140	Q96RY7	1462 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SOGA1	O94964	1423 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	CD33	P20138	364 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	CTBS	Q01459	385 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	TCEAL1	Q15170	157 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SORBS3	O60504	671 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PDGFA	P04085	211 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF76	P36508	570 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	DAB2	P98082	770 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RASSF7	Q02833	373 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	DSC3	Q14574	896 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRO	Q16827	1216 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM182B	Q5T319	152 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MRS2	Q9HD23	443 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNB2	Q92953	911 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR97	A6NE52	1622 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	C2CD2L	O14523	706 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	PCSK2	P16519	638 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MX2	P20592	715 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFB5	O43674	189 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	EGFR	P00533	1210 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHA2	P01877	340 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK8	P45983	427 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	IGBP1	P78318	339 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT76	Q01546	638 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms