RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ATF3P18847 181 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP6P59044 892 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 VPS18Q9P253 973 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NSD2O96028 1365 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 KRT86O43790 486 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SYKP43405 635 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 VAV2P52735 878 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SPG7Q9UQ90 795 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD11A6QL63 1104 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NAPBQ9H115 298 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NCOA1Q15788 1441 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SYT1P21579 422 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IQCA1Q86XH1 822 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NEDD9Q14511 834 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC89Q8N998 374 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GIPC1O14908 333 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NAA25Q14CX7 972 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC1Q9NV70 894 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 DNAI1Q9UI46 699 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 N4BP3O15049 544 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PPFIA3O75145 1194 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SYNCQ9H7C4 482 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 VPS52Q8N1B4 723 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ATP2A3Q93084 1043 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CABP4P57796 275 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ERO1AQ96HE7 468 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 DNA2P51530 1060 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT8Q92599 483 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SPAG5Q96R06 1193 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TTC36A6NLP5 189 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CETN3O15182 167 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TTC22Q5TAA0 569 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 B4DLN1 442 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP5P59047 1200 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ERMNQ8TAM6 284 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 AKR1B10O60218 316 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TMX1Q9H3N1 280 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF213O14771 459 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NUCB1Q02818 461 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ATL3Q6DD88 541 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BP5O60239 455 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 KIF11P52732 1056 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TYRO3Q06418 890 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K12Q12852 859 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CDK19Q9BWU1 502 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IL16Q14005 1332 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 DRC3Q9H069 523 aa7.87□□□□□ -1.15
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