RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 PTPRKQ15262 1439 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TIMM44O43615 452 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 COQ9O75208 318 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ATG7O95352 703 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CD151P48509 253 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TCEAL1Q15170 157 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 IL17RAQ96F46 866 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 KCNMA1Q12791 1236 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 POU4F2Q12837 409 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NR1H3Q13133 447 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.7□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.7□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NCOA1Q15788 1441 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 GPR25O00155 361 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 PRC1O43663 620 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RECKO95980 971 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 IGHDP01880 384 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TGFB3P10600 412 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TERF1P54274 439 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RNF20Q5VTR2 975 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP3Q96P20 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 PIF1Q9H611 641 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ADAMTS2O95450 1211 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 SLURP2P0DP57 97 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NAT1P18440 290 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 GSK3AP49840 483 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ERVK-9P63128 1117 aa6.68□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 SVIPQ8NHG7 77 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 MUC3BQ9H195 1237 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 STK26Q9P289 416 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.68□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TOPBP1Q92547 1522 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 GDF11O95390 407 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 FGAP02671 866 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 LDHCP07864 332 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 COL6A1P12109 1028 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 POU5F1BQ06416 359 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 DBN1Q16643 649 aa6.67□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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CAPN3-211ENST00000562199 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CASS4Q9NQ75 786 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 HIP1RO75146 1068 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 FAM163BP0C2L3 166 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 CASQ1P31415 396 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 ATICP31939 592 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPN3-211ENST00000562199 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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