RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551127.5

TPCN1-218, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 2

Gene TPCN1, Length 2,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-218ENST00000551127 KCNQ3O43525 872 aa15.92■□□□□ 0.14
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TPCN1-218ENST00000551127 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.92■□□□□ 0.14
TPCN1-218ENST00000551127 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.92■□□□□ 0.14
TPCN1-218ENST00000551127 FERMT3Q86UX7 667 aa15.92■□□□□ 0.14
TPCN1-218ENST00000551127 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TPCN1-218ENST00000551127 CCDC69A6NI79 296 aa15.92■□□□□ 0.14
TPCN1-218ENST00000551127 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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TPCN1-218ENST00000551127 MAP4K1Q92918 833 aa15.91■□□□□ 0.14
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TPCN1-218ENST00000551127 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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TPCN1-218ENST00000551127 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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TPCN1-218ENST00000551127 TEFQ10587 303 aa15.87■□□□□ 0.13
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TPCN1-218ENST00000551127 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.87■□□□□ 0.13
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TPCN1-218ENST00000551127 COL18A1P39060 1754 aa15.85■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.85■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 CYP27B1O15528 508 aa15.85■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.85■□□□□ 0.13
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TPCN1-218ENST00000551127 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.84■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 GPATCH3Q96I76 525 aa15.84■□□□□ 0.13
TPCN1-218ENST00000551127 BTBD11A6QL63 1104 aa15.83■□□□□ 0.12
TPCN1-218ENST00000551127 BECN2A8MW95 431 aa15.83■□□□□ 0.12
TPCN1-218ENST00000551127 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
TPCN1-218ENST00000551127 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.83■□□□□ 0.12
TPCN1-218ENST00000551127 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.83■□□□□ 0.12
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