RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 BDNFP23560 247 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SEMA3FQ13275 785 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ITSN1Q15811 1721 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PTPRUQ92729 1446 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 RUNDC1Q96C34 613 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF4Q96M43 638 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EFCC1Q9HA90 598 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 USP31Q70CQ4 1352 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ANKARQ7Z5J8 1434 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP69A5D8W1 941 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 APAF1O14727 1248 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 IRF6O14896 467 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 USP46P62068 366 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PDE3AQ14432 1141 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 C4orf46Q504U0 113 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 DPH6Q7L8W6 267 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MORC1Q86VD1 984 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CDK19Q9BWU1 502 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GPR37O15354 613 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 VSIG8P0DPA2 414 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 LIG1P18858 919 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SCP2P22307 547 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MTHFSP49914 203 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP53Q96M91 514 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOPCQ9HD26 462 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 JADE2Q9NQC1 790 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 TBX22Q9Y458 520 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NWD1Q149M9 1564 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 USP6P35125 1406 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CARNS1A5YM72 827 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MAN1A2O60476 641 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 KIF4AO95239 1232 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CD46P15529 392 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CEP83Q9Y592 693 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MST1RQ04912 1400 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 LRRC37A3O60309 1634 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 SH3BP5O60239 455 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 JUNDP17535 347 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 LTKP29376 864 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EVA1CP58658 441 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MTA1Q13330 715 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF280DQ6N043 979 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CXorf38Q8TB03 319 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms