RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 NBR1Q14596 966 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 NECTIN1Q15223 517 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 SMIM5Q71RC9 77 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TTC14Q96N46 770 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ARXQ96QS3 562 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RTL9Q8NET4 1388 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PARP10Q53GL7 1025 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 HSCBQ8IWL3 235 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 MAP4K1Q92918 833 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 NARFQ9UHQ1 456 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 A0A1B0GUL7 405 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 GNPATO15228 680 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PDE8AO60658 829 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ITGA6P23229 1130 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ADORA1P30542 326 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SCARF1Q14162 830 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TXNRD1Q16881 649 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PROM2Q8N271 834 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 GPATCH3Q96I76 525 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 AK7Q96M32 723 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 APBA3O96018 575 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 FGFR2P21802 821 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CUL4AQ13619 759 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ABCC12Q96J65 1359 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 FOXP2O15409 715 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SSFA2P28290 1259 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ZPR1O75312 459 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TAF5LO75529 589 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 XAGE2Q96GT9 111 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RFC4P35249 363 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 NEK4P51957 841 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ST3GAL1Q11201 340 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TICAM2Q86XR7 235 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TMX3Q96JJ7 454 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PDE8BO95263 885 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PKP1Q13835 747 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 PI16Q6UXB8 463 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 FSD1Q9BTV5 496 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SNAP23O00161 211 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 HIP1O00291 1037 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CPA1P15085 419 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 MCAMP43121 646 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-203ENST00000546585 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.35□□□□□ -1.07
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