RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 GTF2IP78347 998 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 AOC3Q16853 763 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 EYA3Q99504 573 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ADCY9O60503 1353 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 NTSR2O95665 410 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 RASSF7Q02833 373 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 CHRNDQ07001 517 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 PRKG1Q13976 671 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 UTRNP46939 3433 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 VEZTQ9HBM0 779 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 BBOX1O75936 387 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 AAMPQ13685 434 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 GRAPQ13588 217 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 NFKBIBQ15653 356 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 EYA2O00167 538 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 FSD1Q9BTV5 496 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 MTMR7Q9Y216 660 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 H7C1W4 665 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 BCAMP50895 628 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ATP8B2P98198 1209 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 CEP85Q6P2H3 762 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 SRGNP10124 158 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 SCNN1DP51172 638 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-202ENST00000538886 A0A1B0GUL7 405 aa10.65□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 GRIN3BO60391 1043 aa10.65□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TM4SF1P30408 202 aa10.65□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.65□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ABCC4O15439 1325 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 GOLIM4O00461 696 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 CASC1Q6TDU7 716 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ABCC6O95255 1503 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 SLC51AQ86UW1 340 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ABCC12Q96J65 1359 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TGFB2P61812 414 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ERC2O15083 957 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 GPSM2P81274 684 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 YY1P25490 414 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 PICALMQ13492 652 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 COL18A1P39060 1754 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 IGHDP01880 384 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 MFSD14BQ5SR56 506 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 XDHP47989 1333 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ATP2B2Q01814 1243 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 SOGA3Q5TF21 947 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 XAGE2Q96GT9 111 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 H7C1D1 291 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ADORA1P30542 326 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 PDE8BO95263 885 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 ATP2B4P23634 1241 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 PI16Q6UXB8 463 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-202ENST00000538886 MXD3Q9BW11 206 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms