RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 ELP3Q9H9T3 547 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 FAM229AH3BQW9 127 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 ICMTO60725 284 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 NID1P14543 1247 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 OR13H1Q8NG92 308 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 RBSNQ9H1K0 784 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.09□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 SOX18P35713 384 aa8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 SPACA7Q96KW9 195 aa8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.08□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 KRBA1A5PL33 1030 aa8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 FZD6O60353 706 aa8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 HYAL2Q12891 473 aa8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 PLD4Q96BZ4 506 aa8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.07□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 BRD1O95696 1058 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 USP5P45974 858 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 CNTN3Q9P232 1028 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.06□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.05□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 CES1P23141 567 aa8.05□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.05□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 ATP11AP98196 1134 aa8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 EHHADHQ08426 723 aa8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 MSL1Q68DK7 614 aa8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 XKR5Q6UX68 686 aa8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.04□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 MSTNO14793 375 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 RAC1P63000 192 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 GRIK4Q16099 956 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 GRIK5Q16478 980 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 CEP135Q66GS9 1140 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0A0MRY4 1105 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 NDUFB5O43674 189 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 PHACTR2O75167 634 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 APBA3O96018 575 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TMC1Q8TDI8 760 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TTC9Q92623 222 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TNFRSF21O75509 655 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNA4P43681 627 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP4P98171 946 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 ECM1Q16610 540 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 GJD3Q8N144 294 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.01□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SOWAHDA6NJG2 315 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 EREGO14944 169 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 KIF4AO95239 1232 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 ITGB2P05107 769 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 ACPPP15309 386 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 CD163Q86VB7 1156 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SNX29Q8TEQ0 813 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 PMEPA1Q969W9 287 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 CHRDQ9H2X0 955 aa8□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 CDC25BP30305 580 aa7.99□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.99□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.99□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TRPA1O75762 1119 aa7.98□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 Q8N3U1 123 aa7.98□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 CEP120Q8N960 986 aa7.98□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 PBX4Q9BYU1 374 aa7.98□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 FAM177BA6PVY3 158 aa7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 ELNP15502 786 aa7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 NACC1Q96RE7 527 aa7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.97□□□□□ -1.13
CPEB4-210ENST00000522344 PROCP04070 461 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms