RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945		Q8N3U1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MPND	Q8N594	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PZP	P20742	1482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NUP160	Q12769	1436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	C21orf2	O43822	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SLC10A3	P09131	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF75D	P51815	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RWDD2B	P57060	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TRAF1	Q13077	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CRYM	Q14894	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	HDX	Q7Z353	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KIF2C	Q99661	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ATP10A	O60312	1499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945		A6NNZ2	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ERC2	O15083	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TLL1	O43897	1013 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MCM3	P25205	808 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ELF1	P32519	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CDR1	P51861	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ICA1	Q05084	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	BRD3	Q15059	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NES	P48681	1621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	BECN2	A8MW95	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EBAG9	O00559	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CHUK	O15111	745 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NPHP1	O15259	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MAFG	O15525	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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